- Ректорат
- Центр информатизации
- Институт предуниверситетского образования и управления приёмом
- Агробиостанция (АБС)
- Аналитический отдел
- Архив
- Бассейн
- Библиотека
- Департамент научных исследований и информатизации
- Департамент организационной деятельности университета
- Диспетчерская служба
- Институт развития профессиональных компетенций
- Канцелярия
- Контрактная служба
- Музей истории КГУ
- Отдел автоматизированных систем и программного обеспечения
- Отдел аспирантуры
- Отдел ГО, ЧС и ОТ
- Отдел имущественного комплекса
- Отдел кадров преподавателей и сотрудников
- Отдел международной мобильности
- Отдел мониторинга
- Отдел переподготовки медицинских работников
- Отдел по работе со студентами
- Отдел по реализации основных образовательных программ
- Отдел технического обеспечения и эксплуатации
- Правовое управление
- Приемная первого проректора
- Приемная проректора по учебной работе
- Проректор по комплексной безопасности
- Ресурсный координационный центр добровольческих инициатив
- Служба главного энергетика
- Служба содержания зданий и сооружений
- Спортивный клуб
- Студенческий клуб
- Управление бухгалтерского учета
- Управление кадров
- Управление корпоративных и внешних коммуникаций
- Управление культурно-воспитательной деятельности
- Управление науки и грантов
- Управление образовательной политики
- Управление экономического развития
- Управление эксплуатации зданий и сооружений (УЭЗиС)
- Центр международного сотрудничества
- Центр лицензирования, аккредитации и качества образования
- Центр организации практик и трудоустройства выпускников